Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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