Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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USF2Q15853 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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USF2Q15853 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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USF2Q15853 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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USF2Q15853 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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