Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms