Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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