Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHHQ15465 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SHHQ15465 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SHHQ15465 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SHHQ15465 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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SHHQ15465 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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