Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
RYR3Q15413 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms