Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PUM3Q15397 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms