Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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