Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms