Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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