Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GTF2H2Q13888 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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