Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
APOFQ13790 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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