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| RUNX3 | Q13761 | AF212831.1-201 | ENST00000430064 | 377 nt | TSL 3 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022018.1-201 | ENST00000430685 | 241 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C4orf26-202 | ENST00000435974 | 560 nt | TSL 2 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z83839.2-201 | ENST00000436294 | 274 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2D3P1-201 | ENST00000436669 | 444 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108734.1-201 | ENST00000439549 | 399 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC012321.1-201 | ENST00000561622 | 1588 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-621P-201 | ENST00000364752 | 109 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TXNDC8-202 | ENST00000374510 | 455 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-657P-201 | ENST00000383904 | 107 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR649-201 | ENST00000384843 | 97 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASP3-203 | ENST00000393588 | 677 nt | TSL 4 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RPS12P23-201 | ENST00000419579 | 400 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006960.1-201 | ENST00000419980 | 153 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP9YP26-201 | ENST00000421008 | 661 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009313.1-201 | ENST00000425470 | 503 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024619.1-202 | ENST00000426489 | 495 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL122034.1-201 | ENST00000427609 | 497 nt | TSL 2 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND5P25-201 | ENST00000430499 | 799 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LIX1L-AS1-204 | ENST00000437207 | 222 nt | TSL 5 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P11-201 | ENST00000440127 | 604 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND2P22-201 | ENST00000444325 | 1033 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANKRD26P4-201 | ENST00000455755 | 950 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFTRP1-201 | ENST00000456646 | 183 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATG12P2-201 | ENST00000456830 | 416 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL37P6-202 | ENST00000464216 | 403 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001086.1-201 | ENST00000494882 | 321 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRA1P-201 | ENST00000503499 | 986 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PGRMC2-204 | ENST00000503872 | 1028 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LINC02290-203 | ENST00000556662 | 577 nt | TSL 4 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02490-201 | ENST00000559915 | 601 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SULT1C2P1-202 | ENST00000562418 | 459 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035071.2-201 | ENST00000565572 | 459 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087749.2-201 | ENST00000583910 | 352 nt | TSL 5 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006116.8-203 | ENST00000587448 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018638.7-201 | ENST00000605836 | 1114 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097065.2-201 | ENST00000608159 | 533 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009039.2-201 | ENST00000624524 | 529 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CAPZA2-215 | ENST00000639546 | 129 nt | TSL 5 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DCUN1D1-201 | ENST00000292782 | 7954 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161457.2-203 | ENST00000590767 | 2663 nt | TSL 5 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GEN1-201 | ENST00000317402 | 9854 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZMYM1-210 | ENST00000611874 | 4466 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAS2R14-202 | ENST00000537503 | 1858 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107982.1-201 | ENST00000507171 | 1300 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM27-201 | ENST00000380342 | 1578 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DAZ4-201 | ENST00000382296 | 2048 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C2orf73-202 | ENST00000398634 | 1921 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPN22-207 | ENST00000528414 | 3424 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004160.1-212 | ENST00000421121 | 2078 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RICTOR-201 | ENST00000296782 | 7505 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRC4-201 | ENST00000309384 | 930 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR22-201 | ENST00000362190 | 85 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNY3P9-201 | ENST00000384727 | 106 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR124-3-201 | ENST00000384866 | 87 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR506-201 | ENST00000384998 | 124 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD67-201 | ENST00000390833 | 111 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049545.1-201 | ENST00000401856 | 572 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P25-201 | ENST00000404151 | 721 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL450338.1-201 | ENST00000407987 | 512 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUMO1-205 | ENST00000409205 | 534 nt | TSL 2 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004987.3-201 | ENST00000413879 | 771 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EEF1A1P41-201 | ENST00000414667 | 207 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS15AP40-201 | ENST00000419621 | 391 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |