Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms