Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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