Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATRQ13535 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATRQ13535 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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