Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
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