Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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