Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RPA4Q13156 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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