Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms