Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD3Q12873 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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