Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms