Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TROQ12816 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TROQ12816 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TROQ12816 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TROQ12816 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TROQ12816 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TROQ12816 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TROQ12816 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TROQ12816 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TROQ12816 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TROQ12816 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TROQ12816 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TROQ12816 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TROQ12816 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TROQ12816 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TROQ12816 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROQ12816 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms