Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TFCP2Q12800 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms