Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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HOXD10P28358 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HOXD10P28358 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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