Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SGCZQ96LD1 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SGCZQ96LD1 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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