Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
UBXN4Q92575 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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