Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms