Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms