Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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SGCBQ16585 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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