Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms