Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNCBQ16143 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNCBQ16143 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNCBQ16143 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNCBQ16143 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNCBQ16143 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNCBQ16143 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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