Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HMGN3Q15651 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HMGN3Q15651 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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