Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms