Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PUM3Q15397 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms