Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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NKX1-1Q15270 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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NKX1-1Q15270 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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NKX1-1Q15270 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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NKX1-1Q15270 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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NKX1-1Q15270 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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