Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRKQ15262 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRKQ15262 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms