Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SCARF1Q14162 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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