Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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PDE6HQ13956 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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PDE6HQ13956 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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PDE6HQ13956 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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PDE6HQ13956 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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