Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCINQ13939 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCINQ13939 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms