Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
KLF9Q13886 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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