Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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