Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms