Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SP140Q13342 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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