Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATMQ13315 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATMQ13315 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATMQ13315 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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