Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIN2BQ13224 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms