Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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