Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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