Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms