Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
STRN3Q13033 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
STRN3Q13033 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.7 ms