Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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